Aquest tipus de certificat permet a una persona jurídica identificar-se telemàticament i fer signatura electrònica sense que sigui necessària la incorporació de les dades d’un representant, i és especialment adequat per a autenticació i signatura entre components informàtics de manera desatesa en processos automatitzats. Com per exemple per a la generació de rebuts, factures, enviament de correus.

El certificat de segell electrònic pot estar associat a una clau custodiada per una màquina que realitza firmes electròniques desateses, necessàries per dotar d’integritat i autenticitat els documents i les transaccions sobre els quals s’aplica.

Addicionalment també es pot utilitzar com a element d’identificació de màquina a client en protocols de comunicació segurs com a SSL i signatura de comunicació per Web Services amb FACe per a la Factura Electrònica.